Amín Nawabi (seudónimo), un investigador universitario de éxito de treinta y seis años, lucha contra un doloroso secreto que oculta desde hace veinte años y que podría poner en jaque la vida que ha construido para él y para su futuro marido. El director Jonas Poher Rasmussen recurre principalmente a la animación para proteger la identidad de Amín y al mismo tiempo dar voz a su amigo y ex compañero de clase, que relata por primera vez la historia del viaje extraordinario que emprendió siendo un niño para escapar de Afganistán como refugiado. A través de una serie de conmovedoras entrevistas entre Jonas y Amín, Flee nos cuenta una historia inolvidable de autodescubrimiento. La película nos enseña que, para labrarse un futuro, es necesario enfrentarse al pasado y que, para entender el auténtico significado de la palabra «hogar», hay que dejar de huir de uno mismo.